paragongenomics適用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex®

該基于擴(kuò)增子的SARS-CoV-2 NGS面板專為COVID19冠狀病毒研究和監(jiān)測(cè)而設(shè)計(jì)，可對(duì)負(fù)責(zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進(jìn)行完整的基因組測(cè)序。該面板專門針對(duì)MGI Tech的DNBSEQ平臺(tái)。其他版本可用于  Illumina測(cè)序平臺(tái)。 

SKU：paragongenomics 918001

類別：CleanPlex對(duì)于MGI，CleanPlex為MGI現(xiàn)成的使用面板，傳染病，產(chǎn)品，準(zhǔn)備到使用NGS面板標(biāo)簽：靶富集，靶向測(cè)序，擴(kuò)增子測(cè)序，多重PCR，下一代測(cè)序，定向重測(cè)序，NGS面板，NGS測(cè)定，PCR擴(kuò)增子測(cè)序，SARS-CoV的-2 ，研究面板，COVID19，2019-nCoV，傳染性疾病監(jiān)測(cè)

產(chǎn)品描述

用于MGI SARS-CoV-2的CleanPlex®面板，用于通過(guò)MGI Tech的DNBSEQ平臺(tái)上的下一代測(cè)序（NGS）的基于擴(kuò)增子的靶標(biāo)富集檢測(cè)，跟蹤和研究COVID19冠狀病毒

Paragon Genomics設(shè)計(jì)了一個(gè)高度多重的靶標(biāo)富集板，覆蓋了SARS-CoV-2病毒的整個(gè)基因組（末端的92個(gè)堿基除外）。該小組能夠?qū)ω?fù)責(zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進(jìn)行完整的基因組測(cè)序和流行病學(xué)研究。借助Paragon Genomics CleanPlex技術(shù)，可在5小時(shí)內(nèi)將病毒的整個(gè)基因組從RNA擴(kuò)增到序列就緒的文庫(kù)。該面板的兩個(gè)版本可用于兩個(gè)主要的測(cè)序平臺(tái)：Illumina和MGI。CleanPlex技術(shù)可輕松，靈活地對(duì)樣品進(jìn)行測(cè)序，以確保對(duì)傳染病的監(jiān)測(cè)和研究。

強(qiáng)調(diào)

• 節(jié)省大量成本
  降低測(cè)序成本98％。許多散彈槍宏基因組測(cè)序方法所需的每個(gè)樣品僅需要0.2M讀數(shù)，而  1000萬(wàn)個(gè)讀數(shù)。
• 目標(biāo)區(qū)域的高覆蓋率
  整個(gè)SARS-CoV-2基因組的覆蓋率達(dá)到99％
• 靈敏檢測(cè)
  可以高置信度檢測(cè)多達(dá)1個(gè)拷貝，而RT-qPCR可以檢測(cè)3-5個(gè)拷貝（1）
• 快速，簡(jiǎn)化的工作流程
  使用快速的四步協(xié)議（包括RT步驟）以少的動(dòng)手時(shí)間，只需5.5小時(shí)即可生成可測(cè)序的文庫(kù)。
• 性能超群
  準(zhǔn)備高質(zhì)量的NGS庫(kù)具有優(yōu)良的對(duì)目標(biāo)使用CleanPlex技術(shù)，使高效利用測(cè)序讀取性能。CleanPlex專家組的準(zhǔn)靶率通常比混合捕獲的小靶標(biāo)富集專家組的靶率高得多。

CleanPlex SARS-CoV-2面板包含帶有RT組件的CleanPlex多重PCR引物和CleanPlex靶向庫(kù)試劑盒。CleanPlex索引PCR引物和CleanMag ^®  磁珠單獨(dú)訂購(gòu)?fù)瓿蓮妮斎隦NA工作流測(cè)序就緒NGS庫(kù)。

儲(chǔ)存溫度

儲(chǔ)存在-20°C。

（1）Corman VM等。通過(guò)實(shí)時(shí)RT-PCR檢測(cè)（2019-nCoV）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

僅供研究使用。不用于診斷過(guò)程。

（左）使用含有SARS-CoV-2的N和S基因的質(zhì)粒，通過(guò)一個(gè)單一的工作流程進(jìn)行檢測(cè)，顯示了低拷貝數(shù)下的檢測(cè)率。結(jié)果表明，檢出率為1.1份時(shí)為56％，當(dāng)存在2份以上時(shí)為100％。通過(guò)使用兩個(gè)池來(lái)覆蓋整個(gè)病毒基因組，預(yù)期靈敏度只會(huì)進(jìn)一步提高。（右）對(duì)于檢測(cè)到的這些，該小組能夠平均捕獲10倍讀取深度范圍內(nèi)的所有靶標(biāo)，以獲得2.8個(gè)病毒拷貝，類似地，除了一個(gè)靶標(biāo)外，所有靶標(biāo)均捕獲1.4個(gè)病毒拷貝。所有目標(biāo)也均勻分布在整個(gè)GC范圍內(nèi)。

附加信息